CNS-infektioner, snabb-PCR

Klinisk misstanke om akut meningit/encefalit.

Obs! Metoden kompletterar (ersätter inte!) odlingsdiagnostik av bakteriella CNS-infektioner. Övriga analyser ordineras och skickas till motsvarande laboratorieenhet med separat beställning enligt gällande rutiner.

Medicinsk bakgrund

Vid akut CNS-infektion är tidig diagnos viktig för snabb och korrekt behandling. FilmArray meningit/encefalit-panel är en snabb-PCR av 14 patogener (virus, bakterier och svamp) som kan orsaka CNS-infektion. Eftersom resultat kan erhållas redan efter en timma kan snabb-PCR användas för att ge underlag för t.ex. antiviral behandling eller beslut om hur patienter ska vårdas.

Virusencefalit misstänks om patienten har symtom eller statusfynd talande för hjärnengagemang, såsom fokalneurologi, kramper, medvetandepåverkan eller förvirring oftast förenat med feber och neuroradiologiska eller neurofysiologiska fynd, likvorceller > 5 miljoner/L (dominans lymfocyter och monocyter).

Allvarlig encefalit orsakas fr.a. av herpes simplexvirus typ 1, TBE-virus (fästingburen hjärninflammation, den vanligaste orsaken under sommar och höst) och varicella-zostervirus, medan mindre allvarlig meningoencefalit orsakas av enterovirus, HSV-2 och VZV. Influensa A och influensa B kan i sällsynta fall orsaka CNS-infektion. Andra ovanliga orsaker är cytomegalovirus (CMV) , Epstein-Barrvirus, HHV-6 och mässlingvirus (morbilli). HSV-2 kan orsaka generaliserad encefalit hos nyfödda.

Vid HSV-1-encefalit kan PCR vara negativ de första dagarna (ca 3 dagar från neurologisk symtomdebut) i sjukdomsförloppet - upprepa lumbalpunktionen om misstanken kvarstår.

Bakteriell meningit är en mycket allvarlig infektion som kan drabba människor i alla åldrar. Snabb och korrekt initial handläggning är avgörande för en god prognos. Etiologin skiljer sig mellan olika åldersgrupper, men bortsett från nyfödda (< 1 månad), patienter med skallbasfraktur och patienter med främmande material i CNS, dominerar fyra bakterier: (1) Streptococcus pneumoniae (Pneumokocker, (2) Neisseria meningitidis (Meningokocker), (3) Haemophilus influenzae (minskat betydligt sedan införandet av allmän HIb-vaccination) och (4) Listeria monocytogenes. Hos nyfödda är vanligaste agens E. coli, grupp B-streptokocker och Listeria

Remiss

Remiss för Laboratorium för klinisk mikrobiologi. I andra kolumnen under BLODODLING/LIKVOR finns CNS-infektioner (snabb-PCR). Kryssa i rutan och lämna relevanta kliniska data.

Material

Likvor, cerebrospinalvätska (CSV) tagen aseptiskt via lumbalpunktion, gärna > 1 mL. OBS! metoden är inte avsedd för likvor insamlad via medicintekniska produkter, t.ex. shuntar.

Provtagning

Minst 1 ml likvor i ett rör utan tillsats ("urinrör", rör med gult skruvlock 10 ml, 100x16mm, sterilt), art.nr 102769965.

Huden desinfekteras med 70% alkohol. Låt lufttorka. Cerebrospinalvätska ("likvor") får droppa ner i ett sterilt rör.

Transport och förvaring

Provet ska transporteras till Klinisk mikrobiologi så snart som möjligt. Förvaras i kyl i avvaktan på transport. Kan transporteras i rumstemperatur.

Svar

Positiv/Negativ

Obs! Negativt resultat utesluter inte CNS-infektion. Diskussion med infektionskonsult rekommenderas för tolkning av resultat.

Mätprincip

PCR

Ackrediterad

Nej

Hur ofta körs analysen

Analysen utförs vardagar 07.30-16.30, samt helgdagar 08.00-13.00.

OBS! Prover tagna efter kl15.00 vardagar samt efter kl 11.00 på helgdagar besvaras dagen efter. Svarstid ca 2timmar efter ankomst till labb.