F-bakt gastroentrit PCR
Medicinsk bakgrund
Diagnostiken syftar till att påvisa diarréorsakande bakteriers DNA. Som rutin diagnostiseras Salmonella spp, Shigella spp/EIEC, Campylobacter, EHEC,ETEC, Yersinia.enterocolitica, Vibrio och Plesiomonas
Remiss
Remiss för Laboratorium för klinisk mikrobiologi
Ange inhemsk/utlandsförvärvad smitta. Kryssa för om patienten har blodiga diarréer. Ange alltid relevanta kliniska data, misstänkt infektionsort samt misstänkt smittkälla.
Obs! Varje remiss skall åtföljas av ett prov för vilket en önskad undersökning anges!
På den nya remissen ingår alla ovanstående agens om man kryssar i denna undersökning
Material
-
Faeces
-
Provtagningsmaterial eSwab
Provtagning
Pottprov
Pinnen doppas i faeces som finns på blöja, bäcken eller ovanpå toapapper i rent kärl. Pinnen nedföres och lämnas kvar i röret.
Analsvabb
Stryk den bomullsarmerade delen av provtagningspinnen mot ändtarmsöppningen genast efter avföring. Se till att den blivit förorenad med avföring. Pinnen nedföres och lämnas kvar i röret.
Rektalsvabb
För in pinnen i rectum. Kontrollera att det finns avföring på pinnen. Pinnen nedföres och lämnas kvar i röret.
Transport och förvaring
Snarast till Laboratorium för klinisk mikrobiologi. Provet kylförvaras i väntan på transport. Kyltransporteras. Obs! Shigellabakterien har kort överlevnadstid. Provet bör vara på laboratoriet inom 48 timmar. Om ej kyltransport till laboratoriet inom 24 timmar.
Svar
Analys utöres vardagar oftast samma dygn som provet inkommit.
| Analysresultat | Svar ut till kund |
| Shigella positivt | Shigella spp/EIEC DNA påvisats. Odling kommer även att utföras på detta prov och svaras separat |
| Shigella negativt | Inget Shigella spp/EIEC DNA påvisats |
| STX (Shiga toxin) positivt | Shiga toxin producerande gener påvisade. Odling kommer även att utföras på detta prov på SU för att bla verifiera toxintyp och art (EHEC) och svaras separat |
| STX (Shiga toxin) negativt | Inga Shiga toxin producerande gener påvisade. Således även negativt för EHEC |
| Champylobacter positivt | Champylobacter spp (jejuni och coli) DNA påvisats |
| Champylobacter negativt | Inget Champylobacter spp (jejuni och coli) DNA påvisats |
| Salmonella positiv | Salmonella spp DNA påvisats. Odling kommer att utföras på inhemska prov eller vid speciell förfrågan och svaras ut separat |
| Salmonella negativt | Inget Salmonella spp DNA påvisats. |
| Plesiomonas positivt | Plesiomonas shigelloides DNA påvisats |
| Plesiomonas negativt | |
| Vibrio positivt | Vibrio (V.vulnificus,V.parahaemolyticus och/eller V.cholerae) DNA påvisats |
| Vibrio negativt | Inget Vibrio (V.vulnificus, V.parahaemolyticus och/eller V.cholerae) DNA påvisats |
| ETEC positivt | Enterotoxin E.coli (ETEC, Värmelabilt och/eller värmestabilt) DNA påvisats |
| ETEC negativt | Inget enterotoxin E.coli (ETEC, Värmelabilt och/eller värmestabilt) DNA påvisats |
| Yersinia positivt | Yersinia enterocolitica DNA påvisats. Odling kommer att utföras på detta prov |
| Yersinia negativt | Inget Yersinia enterocolitica DNA påvisats |
Vid positivt fynd lämnas telefonsvar.
Obs! Flera av fynden är Anmälningspliktiga enligt Smittskyddslagen.
Mätprincip
PCR ( polymeras chain reaction)
Odling utföres på prover där speciella krav finns eller där DNA fyndet måste verifieras
Prioritet
4
Vid verifiering vid annat ackrediterat laboratorium kan svarstiden förlängas.
